TRPM1

Ідентифікатори

Символи

TRPM1, CSNB1C, LTRPC1, MLSN1, transient receptor potential cation channel subfamily M member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603576 MGI: 1330305 HomoloGene: 19940 GeneCards: TRPM1

Пов'язані генетичні захворювання

congenital stationary night blindness 1C^[1]

Реагує на сполуку

pregnenolone sulfate^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium channel activity • ion channel activity • cation channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • new growing cell tip
Біологічний процес	• G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • calcium ion transport into cytosol • відповідь на стимул • ion transport • protein tetramerization • calcium ion transmembrane transport • retinal rod cell development • cellular response to light stimulus • зір • GO:0072468 сигнальна трансдукція • ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • cation transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4308


17364

Ensembl


ENSG00000274965 ENSG00000134160


ENSMUSG00000030523

UniProt


Q7Z4N2


Q2TV84

RefSeq (мРНК)


NM_001252020 NM_001252024 NM_001252030 NM_002420


NM_001039104 NM_018752

RefSeq (білок)


NP_001238949 NP_001238953 NP_001238959 NP_002411


NP_001034193 NP_061222

Локус (UCSC)

Хр. 15: 31 – 31.16 Mb

Хр. 7: 63.8 – 63.92 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPM1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 603 амінокислот, а молекулярна маса — 182 178^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKDSNRCCCG	QFTNQHIPPL	PSATPSKNEE	ESKQVETQPE	KWSVAKHTQS
YPTDSYGVLE	FQGGGYSNKA	MYIRVSYDTK	PDSLLHLMVK	DWQLELPKLL
ISVHGGLQNF	EMQPKLKQVF	GKGLIKAAMT	TGAWIFTGGV	STGVISHVGD
ALKDHSSKSR	GRVCAIGIAP	WGIVENKEDL	VGKDVTRVYQ	TMSNPLSKLS
VLNNSHTHFI	LADNGTLGKY	GAEVKLRRLL	EKHISLQKIN	TRLGQGVPLV
GLVVEGGPNV	VSIVLEYLQE	EPPIPVVICD	GSGRASDILS	FAHKYCEEGG
IINESLREQL	LVTIQKTFNY	NKAQSHQLFA	IIMECMKKKE	LVTVFRMGSE
GQQDIEMAIL	TALLKGTNVS	APDQLSLALA	WNRVDIARSQ	IFVFGPHWPP
LGSLAPPTDS	KATEKEKKPP	MATTKGGRGK	GKGKKKGKVK	EEVEEETDPR
KIELLNWVNA	LEQAMLDALV	LDRVDFVKLL	IENGVNMQHF	LTIPRLEELY
NTRLGPPNTL	HLLVRDVKKS	NLPPDYHISL	IDIGLVLEYL	MGGAYRCNYT
RKNFRTLYNN	LFGPKRPKAL	KLLGMEDDEP	PAKGKKKKKK	KKEEEIDIDV
DDPAVSRFQY	PFHELMVWAV	LMKRQKMAVF	LWQRGEESMA	KALVACKLYK
AMAHESSESD	LVDDISQDLD	NNSKDFGQLA	LELLDQSYKH	DEQIAMKLLT
YELKNWSNST	CLKLAVAAKH	RDFIAHTCSQ	MLLTDMWMGR	LRMRKNPGLK
VIMGILLPPT	ILFLEFRTYD	DFSYQTSKEN	EDGKEKEEEN	TDANADAGSR
KGDEENEHKK	QRSIPIGTKI	CEFYNAPIVK	FWFYTISYLG	YLLLFNYVIL
VRMDGWPSLQ	EWIVISYIVS	LALEKIREIL	MSEPGKLSQK	IKVWLQEYWN
ITDLVAISTF	MIGAILRLQN	QPYMGYGRVI	YCVDIIFWYI	RVLDIFGVNK
YLGPYVMMIG	KMMIDMLYFV	VIMLVVLMSF	GVARQAILHP	EEKPSWKLAR
NIFYMPYWMI	YGEVFADQID	LYAMEINPPC	GENLYDEEGK	RLPPCIPGAW
LTPALMACYL	LVANILLVNL	LIAVFNNTFF	EVKSISNQVW	KFQRYQLIMT
FHDRPVLPPP	MIILSHIYII	IMRLSGRCRK	KREGDQEERD	RGLKLFLSDE
ELKRLHEFEE	QCVQEHFREK	EDEQQSSSDE	RIRVTSERVE	NMSMRLEEIN
ERETFMKTSL	QTVDLRLAQL	EELSNRMVNA	LENLAGIDRS	DLIQARSRAS
SECEATYLLR	QSSINSADGY	SLYRYHFNGE	ELLFEDTSLS	TSPGTGVRKK
TCSFRIKEEK	DVKTHLVPEC	QNSLHLSLGT	STSATPDGSH	LAVDDLKNAE
ESKLGPDIGI	SKEDDERQTD	SKKEETISPS	LNKTDVIHGQ	DKSDVQNTQL
TVETTNIEGT	ISYPLEETKI	TRYFPDETIN	ACKTMKSRSF	VYSRGRKLVG
GVNQDVEYSS	ITDQQLTTEW	QCQVQKITRS	HSTDIPYIVS	EAAVQAEHKE
QFADMQDEHH	VAEAIPRIPR	LSLTITDRNG	MENLLSVKPD	QTLGFPSLRS
KSLHGHPRNV	KSIQGKLDRS	GHASSVSSLV	IVSGMTAEEK	KVKKEKASTE
TEC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Fang D., Setaluri V. (2000). Expression and up-regulation of alternatively spliced transcripts of melastatin, a melanoma metastasis-related gene, in human melanoma cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 53—61. PMID 11112417 DOI:10.1006/bbrc.2000.3894
Xu X.-Z.S., Moebius F., Gill D.L., Montell C. (2001). Regulation of melastatin, a TRP-related protein, through interaction with a cytoplasmic isoform. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 10692—10697. PMID 11535825 DOI:10.1073/pnas.191360198

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TRPM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7146 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, Q7Z4N2 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані