CLCN7

Ідентифікатори

Символи

CLCN7, CLC-7, CLC7, OPTA2, OPTB4, PPP1R63, chloride voltage-gated channel 7, HOD

Зовнішні ІД

OMIM: 602727 MGI: 1347048 HomoloGene: 56546 GeneCards: CLCN7

Пов'язані генетичні захворювання

autosomal recessive osteopetrosis 4, autosomal dominant osteopetrosis 2, Malignant infantile osteopetrosis^[1]

Реагує на сполуку

DIDS^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • ion channel activity • antiporter activity • ATP binding • chloride channel activity • voltage-gated chloride channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chloride transmembrane transporter activity • GO:0022891 transmembrane transporter activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • лізосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • lysosomal membrane • мембрана • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела
Біологічний процес	• ion transmembrane transport • chloride transport • ion transport • regulation of anion transmembrane transport • response to pH • трансмембранний транспорт • chloride transmembrane transport • GO:0015915 транспорт
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1186


26373

Ensembl


ENSG00000103249


ENSMUSG00000036636

UniProt


P51798


O70496

RefSeq (мРНК)


NM_001114331 NM_001287


NM_011930 NM_001317404

RefSeq (білок)


NP_001107803 NP_001278


NP_001304333 NP_036060

Локус (UCSC)

Хр. 16: 1.44 – 1.48 Mb

Хр. 17: 25.35 – 25.38 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLCN7 (англ. Chloride voltage-gated channel 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 805 амінокислот, а молекулярна маса — 88 679^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MANVSKKVSW	SGRDRDDEEA	APLLRRTARP	GGGTPLLNGA	GPGAARQSPR
SALFRVGHMS	SVELDDELLD	PDMDPPHPFP	KEIPHNEKLL	SLKYESLDYD
NSENQLFLEE	ERRINHTAFR	TVEIKRWVIC	ALIGILTGLV	ACFIDIVVEN
LAGLKYRVIK	GNIDKFTEKG	GLSFSLLLWA	TLNAAFVLVG	SVIVAFIEPV
AAGSGIPQIK	CFLNGVKIPH	VVRLKTLVIK	VSGVILSVVG	GLAVGKEGPM
IHSGSVIAAG	ISQGRSTSLK	RDFKIFEYFR	RDTEKRDFVS	AGAAAGVSAA
FGAPVGGVLF	SLEEGASFWN	QFLTWRIFFA	SMISTFTLNF	VLSIYHGNMW
DLSSPGLINF	GRFDSEKMAY	TIHEIPVFIA	MGVVGGVLGA	VFNALNYWLT
MFRIRYIHRP	CLQVIEAVLV	AAVTATVAFV	LIYSSRDCQP	LQGGSMSYPL
QLFCADGEYN	SMAAAFFNTP	EKSVVSLFHD	PPGSYNPLTL	GLFTLVYFFL
ACWTYGLTVS	AGVFIPSLLI	GAAWGRLFGI	SLSYLTGAAI	WADPGKYALM
GAAAQLGGIV	RMTLSLTVIM	MEATSNVTYG	FPIMLVLMTA	KIVGDVFIEG
LYDMHIQLQS	VPFLHWEAPV	TSHSLTAREV	MSTPVTCLRR	REKVGVIVDV
LSDTASNHNG	FPVVEHADDT	QPARLQGLIL	RSQLIVLLKH	KVFVERSNLG
LVQRRLRLKD	FRDAYPRFPP	IQSIHVSQDE	RECTMDLSEF	MNPSPYTVPQ
EASLPRVFKL	FRALGLRHLV	VVDNRNQVVG	LVTRKDLARY	RLGKRGLEEL
SLAQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, хлоридом. Локалізований у мембрані, лізосомі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Brandt S., Jentsch T.J. (1995). ClC-6 and ClC-7 are two novel broadly expressed members of the CLC chloride channel family. FEBS Lett. 377: 15—20. PMID 8543009 DOI:10.1016/0014-5793(95)01298-2
Eggermont J. (1998). The exon-intron architecture of human chloride channel genes is not conserved. Biochim. Biophys. Acta. 1397: 156—160. PMID 9565675 DOI:10.1016/S0167-4781(98)00014-1
Graves A.R., Curran P.K., Smith C.L., Mindell J.A. (2008). The Cl-/H+ antiporter ClC-7 is the primary chloride permeation pathway in lysosomes. Nature. 453: 788—792. PMID 18449189 DOI:10.1038/nature06907
Leisle L., Ludwig C.F., Wagner F.A., Jentsch T.J., Stauber T. (2011). ClC-7 is a slowly voltage-gated 2Cl(-)/1H(+)-exchanger and requires Ostm1 for transport activity. EMBO J. 30: 2140—2152. PMID 21527911 DOI:10.1038/emboj.2011.137

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CLCN7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Chloride voltage-gated channel 7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2025 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P51798 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані