KCNJ4

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3GJ9

Ідентифікатори

Символи

KCNJ4, HIR, HIRK2, HRK1, IRK-3, IRK3, Kir2.3, potassium voltage-gated channel subfamily J member 4, potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 4

Зовнішні ІД

OMIM: 600504 MGI: 104743 HomoloGene: 3653 GeneCards: KCNJ4

Реагує на сполуку

Арахідонова кислота, Путресцин, SCH-23390, spermidine, spermine, tetraethylammonium, гідрон^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • voltage-gated ion channel activity • PDZ domain binding • inward rectifier potassium channel activity • G-protein activated inward rectifier potassium channel activity
Клітинна компонента	• синапс • cytoplasmic vesicle membrane • voltage-gated potassium channel complex • міжклітинні контакти • integral component of membrane • мембрана • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • basolateral plasma membrane • postsynaptic membrane • клітинна мембрана
Біологічний процес	• regulation of ion transmembrane transport • ion transport • potassium ion transport • potassium ion import across plasma membrane • cardiac conduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3761


16520

Ensembl


ENSG00000168135


ENSMUSG00000044216

UniProt


P48050


P52189

RefSeq (мРНК)


NM_152868 NM_004981


NM_008427

RefSeq (білок)


NP_004972 NP_690607


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 22: 38.43 – 38.46 Mb

Хр. 15: 79.37 – 79.39 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

KCNJ4 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily J member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 49 500^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHGHSRNGQA	HVPRRKRRNR	FVKKNGQCNV	YFANLSNKSQ	RYMADIFTTC
VDTRWRYMLM	IFSAAFLVSW	LFFGLLFWCI	AFFHGDLEAS	PGVPAAGGPA
AGGGGAAPVA	PKPCIMHVNG	FLGAFLFSVE	TQTTIGYGFR	CVTEECPLAV
IAVVVQSIVG	CVIDSFMIGT	IMAKMARPKK	RAQTLLFSHH	AVISVRDGKL
CLMWRVGNLR	KSHIVEAHVR	AQLIKPYMTQ	EGEYLPLDQR	DLNVGYDIGL
DRIFLVSPII	IVHEIDEDSP	LYGMGKEELE	SEDFEIVVIL	EGMVEATAMT
TQARSSYLAS	EILWGHRFEP	VVFEEKSHYK	VDYSRFHKTY	EVAGTPCCSA
RELQESKITV	LPAPPPPPSA	FCYENELALM	SQEEEEMEEE	AAAAAAVAAG
LGLEAGSKEE	AGIIRMLEFG	SHLDLERMQA	SLPLDNISYR	RESAI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

Perier F., Radeke C.M., Vandenberg C.A. (1994). Primary structure and characterization of a small-conductance inwardly rectifying potassium channel from human hippocampus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6240—6244. PMID 8016146 DOI:10.1073/pnas.91.13.6240
Tang W., Yang X.-C. (1994). Cloning a novel human brain inward rectifier potassium channel and its functional expression in Xenopus oocytes. FEBS Lett. 348: 239—243. PMID 8034048 DOI:10.1016/0014-5793(94)00612-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Coulter K.L., Perier F., Radeke C.M., Vandenberg C.A. (1995). Identification and molecular localization of a pH-sensing domain for the inward rectifier potassium channel HIR. Neuron. 15: 1157—1168. PMID 7576658 DOI:10.1016/0896-6273(95)90103-5
Makhina E.N., Kelly A.J., Lopatin A.N., Mercer R.W., Nichols C.G. (1994). Cloning and expression of a novel human brain inward rectifier potassium channel. J. Biol. Chem. 269: 20468—20474. PMID 8051145

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6265 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
↑ UniProt, P48050 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 22

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані