STAT6

STAT6
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1OJ5, 4Y5W, 4Y5U

Ідентифікатори
Символи STAT6, D12S1644, IL-4-STAT, STAT6B, STAT6C, signal transducer and activator of transcription 6
Зовнішні ІД OMIM: 601512 MGI: 103034 HomoloGene: 2373 GeneCards: STAT6
Пов'язані генетичні захворювання
eosinophilic esophagitis[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

identical protein binding
sequence-specific DNA binding
protein phosphatase binding
DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма
membrane raft
цитоплазма
гіалоплазма
ядерна мембрана

Біологічний процес

GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
T-helper 1 cell lineage commitment
regulation of cell population proliferation
response to cytokine
interleukin-4-mediated signaling pathway
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
cellular response to hydrogen peroxide
mammary gland epithelial cell proliferation
cellular response to reactive nitrogen species
positive regulation of type I interferon production
positive regulation of isotype switching to IgE isotypes
mammary gland morphogenesis
negative regulation of type 2 immune response
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
GO:0072468 сигнальна трансдукція
transcription, DNA-templated
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
cytokine-mediated signaling pathway
positive regulation of cold-induced thermogenesis
defense response
receptor signaling pathway via JAK-STAT
response to peptide hormone
growth hormone receptor signaling pathway via JAK-STAT

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6778
20852
Ensembl
ENSG00000166888
ENSMUSG00000002147
UniProt
P42226
P52633
RefSeq (мРНК)
NM_001178078
NM_001178079
NM_001178080
NM_001178081
NM_003153
NM_009284
RefSeq (білок)
NP_001171549
NP_001171550
NP_001171551
NP_001171552
NP_003144
NP_033310
Локус (UCSC) Хр. 12: 57.1 – 57.13 Mb Хр. 10: 127.48 – 127.5 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

STAT6 (англ. Signal transducer and activator of transcription 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 847 амінокислот, а молекулярна маса — 94 135[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSLWGLVSKMPPEKVQRLYVDFPQHLRHLLGDWLESQPWEFLVGSDAFCC
NLASALLSDTVQHLQASVGEQGEGSTILQHISTLESIYQRDPLKLVATFR
QILQGEKKAVMEQFRHLPMPFHWKQEELKFKTGLRRLQHRVGEIHLLREA
LQKGAEAGQVSLHSLIETPANGTGPSEALAMLLQETTGELEAAKALVLKR
IQIWKRQQQLAGNGAPFEESLAPLQERCESLVDIYSQLQQEVGAAGGELE
PKTRASLTGRLDEVLRTLVTSCFLVEKQPPQVLKTQTKFQAGVRFLLGLR
FLGAPAKPPLVRADMVTEKQARELSVPQGPGAGAESTGEIINNTVPLENS
IPGNCCSALFKNLLLKKIKRCERKGTESVTEEKCAVLFSASFTLGPGKLP
IQLQALSLPLVVIVHGNQDNNAKATILWDNAFSEMDRVPFVVAERVPWEK
MCETLNLKFMAEVGTNRGLLPEHFLFLAQKIFNDNSLSMEAFQHRSVSWS
QFNKEILLGRGFTFWQWFDGVLDLTKRCLRSYWSDRLIIGFISKQYVTSL
LLNEPDGTFLLRFSDSEIGGITIAHVIRGQDGSPQIENIQPFSAKDLSIR
SLGDRIRDLAQLKNLYPKKPKDEAFRSHYKPEQMGKDGRGYVPATIKMTV
ERDQPLPTPELQMPTMVPSYDLGMAPDSSMSMQLGPDMVPQVYPPHSHSI
PPYQGLSPEESVNVLSAFQEPHLQMPPSLGQMSLPFDQPHPQGLLPCQPQ
EHAVSSPDPLLCSDVTMVEDSCLSQPVTAFPQGTWIGEDIFPPLLPPTEQ
DLTKLLLEGQGESGGGSLGAQPLLQPSHYGQSGISMSHMDLRANPSW

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Patel B.K., Keck C.L., O'Leary R.S., Popescu N.C., LaRochelle W.J. (1998). Localization of the human stat6 gene to chromosome 12q13.3-q14.1, a region implicated in multiple solid tumors. Genomics. 52: 192—200. PMID 9782085 DOI:10.1006/geno.1998.5436
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Litterst C.M., Pfitzner E. (2002). An LXXLL motif in the transactivation domain of STAT6 mediates recruitment of NCoA-1/SRC-1. J. Biol. Chem. 277: 36052—36060. PMID 12138096 DOI:10.1074/jbc.M203556200

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з STAT6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11368 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, P42226 (англ.) . Архів оригіналу за 1 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 12
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші