ARHGAP35

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2K85, 3C5H, 3FK2

Ідентифікатори

Символи

ARHGAP35, GRF-1, GRLF1, P190-A, P190A, p190ARhoGAP, p190RhoGAP, Rho GTPase activating protein 35

Зовнішні ІД

OMIM: 605277 MGI: 1929494 HomoloGene: 35136 GeneCards: ARHGAP35

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GTP binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • phospholipid binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0006184 GTPase activity • nucleotide binding • lipid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • actin cytoskeleton • клітинне ядро • цитоскелет • cell projection • клітинна мембрана • мембрана • ciliary basal body
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of Rho protein signal transduction • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • neural tube closure • regulation of cell shape • forebrain development • camera-type eye development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of vascular permeability • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • axon guidance • axonal fasciculation • regulation of actin polymerization or depolymerization • positive regulation of neuron projection development • cell migration • central nervous system neuron axonogenesis • mammary gland development • establishment or maintenance of actin cytoskeleton polarity • cellular response to extracellular stimulus • regulation of actin cytoskeleton organization • wound healing, spreading of cells • positive regulation of cilium assembly • regulation of axonogenesis • neuron projection guidance
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2909


232906

Ensembl


ENSG00000160007


ENSMUSG00000058230

UniProt


Q9NRY4


Q91YM2

RefSeq (мРНК)


NM_004491 NM_024342


NM_172739

RefSeq (білок)


NP_004482


NP_766327

Локус (UCSC)

Хр. 19: 46.86 – 47.01 Mb

Хр. 7: 16.23 – 16.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ARHGAP35 (англ. Rho GTPase activating protein 35) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 499 амінокислот, а молекулярна маса — 170 514^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMMARKQDVR	IPTYNISVVG	LSGTEKEKGQ	CGIGKSCLCN	RFVRPSADEF
HLDHTSVLST	SDFGGRVVNN	DHFLYWGEVS	RSLEDCVECK	MHIVEQTEFI
DDQTFQPHRS	TALQPYIKRA	AATKLASAEK	LMYFCTDQLG	LEQDFEQKQM
PDGKLLVDGF	LLGIDVSRGM	NRNFDDQLKF	VSNLYNQLAK	TKKPIVVVLT
KCDEGVERYI	RDAHTFALSK	KNLQVVETSA	RSNVNVDLAF	STLVQLIDKS
RGKTKIIPYF	EALKQQSQQI	ATAKDKYEWL	VSRIVKNHNE	NWLSVSRKMQ
ASPEYQDYVY	LEGTQKAKKL	FLQHIHRLKH	EHIERRRKLY	LAALPLAFEA
LIPNLDEIDH	LSCIKAKKLL	ETKPEFLKWF	VVLEETPWDA	TSHIDNMENE
RIPFDLMDTV	PAEQLYEAHL	EKLRNERKRV	EMRRAFKENL	ETSPFITPGK
PWEEARSFIM	NEDFYQWLEE	SVYMDIYGKH	QKQIIDKAKE	EFQELLLEYS
ELFYELELDA	KPSKEKMGVI	QDVLGEEQRF	KALQKLQAER	DALILKHIHF
VYHPTKETCP	SCPACVDAKI	EHLISSRFIR	PSDRNQKNSL	SDPNIDRINL
VILGKDGLAR	ELANEIRALC	TNDDKYVIDG	KMYELSLRPI	EGNVRLPVNS
FQTPTFQPHG	CLCLYNSKES	LSYVVESIEK	SRESTLGRRD	NHLVHLPLTL
ILVNKRGDTS	GETLHSLIQQ	GQQIASKLQC	VFLDPASAGI	GYGRNINEKQ
ISQVLKGLLD	SKRNLNLVSS	TASIKDLADV	DLRIVMCLMC	GDPFSADDIL
FPVLQSQTCK	SSHCGSNNSV	LLELPIGLHK	KRIELSVLSY	HSSFSIRKSR
LVHGYIVFYS	AKRKASLAML	RAFLCEVQDI	IPIQLVALTD	GAVDVLDNDL
SREQLTEGEE	IAQEIDGRFT	SIPCSQPQHK	LEIFHPFFKD	VVEKKNIIEA
THMYDNAAEA	CSTTEEVFNS	PRAGSPLCNS	NLQDSEEDIE	PSYSLFREDT
SLPSLSKDHS	KLSMELEGND	GLSFIMSNFE	SKLNNKVPPP	VKPKPPVHFE
ITKGDLSYLD	QGHRDGQRKS	VSSSPWLPQD	GFDPSDYAEP	MDAVVKPRNE
EENIYSVPHD	STQGKIITIR	NINKAQSNGS	GNGSDSEMDT	SSLERGRKVS
IVSKPVLYRT	RCTRLGRFAS	YRTSFSVGSD	DELGPIRKKE	EDQASQGYKG
DNAVIPYETD	EDPRRRNILR	SLRRNTKKPK	PKPRPSITKA	TWESNYFGVP
LTTVVTPEKP	IPIFIERCIE	YIEATGLSTE	GIYRVSGNKS	EMESLQRQFD
QDHNLDLAEK	DFTVNTVAGA	MKSFFSELPD	PLVPYNMQID	LVEAHKINDR
EQKLHALKEV	LKKFPKENHE	VFKYVISHLN	KVSHNNKVNL	MTSENLSICF
WPTLMRPDFS	TMDALTATRT	YQTIIELFIQ	QCPFFFYNRP	ITEPPGARPS
SPSAVASTVP	FLTSTPVTSQ	PSPPQSPPPT	PQSPMQPLLP	SQLQAEHTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Levay M., Settleman J., Ligeti E. (2009). Regulation of the substrate preference of p190RhoGAP by protein kinase C-mediated phosphorylation of a phospholipid binding site. Biochemistry. 48: 8615—8623. PMID 19673492 DOI:10.1021/bi900667y
Bonet R., Ruiz L., Aragon E., Martin-Malpartida P., Macias M.J. (2009). NMR structural studies on human p190-A RhoGAPFF1 revealed that domain phosphorylation by the PDGF-receptor alpha requires its previous unfolding. J. Mol. Biol. 389: 230—237. PMID 19393245 DOI:10.1016/j.jmb.2009.04.035
LeClerc S., Palaniswami R., Xie B.X., Govindan M.V. (1991). Molecular cloning and characterization of a factor that binds the human glucocorticoid receptor gene and represses its expression. J. Biol. Chem. 266: 17333—17340. PMID 1894621

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4591 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9NRY4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма