ITGAL

ITGAL
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4IXD, 1CQP, 1DGQ, 1LFA, 1MJN, 1MQ8, 1MQ9, 1MQA, 1RD4, 1T0P, 1XDD, 1XDG, 1XUO, 1ZON, 1ZOO, 1ZOP, 2ICA, 2K8O, 2M3E, 2O7N, 3BN3, 3BQM, 3BQN, 3E2M, 3EOA, 3EOB, 3F74, 3F78, 3HI6, 3M6F, 3TCX, 5E6S, 5E6R, 5E6U

Ідентифікатори
Символи ITGAL, CD11A, LFA-1, LFA1A, integrin subunit alpha L
Зовнішні ІД OMIM: 153370 MGI: 96606 HomoloGene: 1666 GeneCards: ITGAL
Пов'язані генетичні захворювання
неспецифічний виразковий коліт[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0032403 protein-containing complex binding
зв'язування з іоном металу
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein heterodimerization activity
ICAM-3 receptor activity
cell adhesion molecule binding

Клітинна компонента

integral component of membrane
integrin alphaL-beta2 complex
мембрана
cell surface
integrin complex
екзосома
клітинна мембрана
specific granule membrane

Біологічний процес

leukocyte cell-cell adhesion
heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules
T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell
extracellular matrix organization
receptor clustering
адгезія клітин
regulation of immune response
integrin-mediated signaling pathway
cell-matrix adhesion
inflammatory response
leukocyte migration
GO:0072468 сигнальна трансдукція
Фагоцитоз
neutrophil degranulation
cell-cell adhesion

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3683
16408
Ensembl
ENSG00000005844
ENSMUSG00000030830
UniProt
P20701
P24063
RefSeq (мРНК)
NM_001114380
NM_002209
NM_001253872
NM_001253873
NM_001253874
NM_008400
RefSeq (білок)
NP_001107852
NP_002200
NP_001240801
NP_001240802
NP_001240803
NP_032426
Локус (UCSC) Хр. 16: 30.47 – 30.52 Mb Хр. 7: 126.9 – 126.93 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITGAL (англ. Integrin subunit alpha L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 170 амінокислот, а молекулярна маса — 128 770[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MKDSCITVMAMALLSGFFFFAPASSYNLDVRGARSFSPPRAGRHFGYRVL
QVGNGVIVGAPGEGNSTGSLYQCQSGTGHCLPVTLRGSNYTSKYLGMTLA
TDPTDGSILACDPGLSRTCDQNTYLSGLCYLFRQNLQGPMLQGRPGFQEC
IKGNVDLVFLFDGSMSLQPDEFQKILDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFST
SYKTEFDFSDYVKRKDPDALLKHVKHMLLLTNTFGAINYVATEVFREELG
ARPDATKVLIIITDGEATDSGNIDAAKDIIRYIIGIGKHFQTKESQETLH
KFASKPASEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIYVIEGTSKQDLTSFNMELS
SSGISADLSRGHAVVGAVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFIGNEPLTPEVR
AGYLGYTVTWLPSRQKTSLLASGAPRYQHMGRVLLFQEPQGGGHWSQVQT
IHGTQIGSYFGGELCGVDVDQDGETELLLIGAPLFYGEQRGGRVFIYQRR
QLGFEEVSELQGDPGYPLGRFGEAITALTDINGDGLVDVAVGAPLEEQGA
VYIFNGRHGGLSPQPSQRIEGTQVLSGIQWFGRSIHGVKDLEGDGLADVA
VGAESQMIVLSSRPVVDMVTLMSFSPAEIPVHEVECSYSTSNKMKEGVNI
TICFQIKSLIPQFQGRLVANLTYTLQLDGHRTRRRGLFPGGRHELRRNIA
VTTSMSCTDFSFHFPVCVQDLISPINVSLNFSLWEEEGTPRDQRAQGKDI
PPILRPSLHSETWEIPFEKNCGEDKKCEANLRVSFSPARSRALRLTAFAS
LSVELSLSNLEEDAYWVQLDLHFPPGLSFRKVEMLKPHSQIPVSCEELPE
ESRLLSRALSCNVSSPIFKAGHSVALQMMFNTLVNSSWGDSVELHANVTC
NNEDSDLLEDNSATTIIPILYPINILIQDQEDSTLYVSFTPKGPKIHQVK
HMYQVRIQPSIHDHNIPTLEAVVGVPQPPSEGPITHQWSVQMEPPVPCHY
EDLERLPDAAEPCLPGALFRCPVVFRQEILVQVIGTLELVGEIEASSMFS
LCSSLSISFNSSKHFHLYGSNASLAQVVMKVDVVYEKQMLYLYVLSGIGG
LLLLLLIFIVLYKVGFFKRNLKEKMEAGRGVPNGIPAEDSEQLASGQEAG
DPGCLKPLHEKDSESGGGKD

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Larson R.S., Corbi A.L., Berman L., Springer T. (1989). Primary structure of the leukocyte function-associated molecule-1 alpha subunit: an integrin with an embedded domain defining a protein superfamily. J. Cell Biol. 108: 703—712. PMID 2537322 DOI:10.1083/jcb.108.2.703
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Shelley C.S., Farokhzad O.C., Arnaout M.A. (1993). Identification of cell-specific and developmentally regulated nuclear factors that direct myeloid and lymphoid expression of the CD11a gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5364—5368. PMID 8099450 DOI:10.1073/pnas.90.11.5364
  • Cornwell R.D., Gollahon K.A., Hickstein D.D. (1993). Description of the leukocyte function-associated antigen 1 (LFA-1 or CD11a) promoter. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 4221—4225. PMID 8097887 DOI:10.1073/pnas.90.9.4221
  • Ostermann G., Weber K.S., Zernecke A., Schroeder A., Weber C. (2002). JAM-1 is a ligand of the beta(2) integrin LFA-1 involved in transendothelial migration of leukocytes. Nat. Immunol. 3: 151—158. PMID 11812992 DOI:10.1038/ni755
  • Barber D.F., Faure M., Long E.O. (2004). LFA-1 contributes an early signal for NK cell cytotoxicity. J. Immunol. 173: 3653—3659. PMID 15356110 DOI:10.4049/jimmunol.173.6.3653

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ITGAL переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6148 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, P20701 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 16
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Білки: кластери диференціації
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350