SNTB2 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

SNTB2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2VRF

Ідентифікатори

Символи

SNTB2, D16S2531E, EST25263, SNT2B2, SNT3, SNTL, syntrophin beta 2

Зовнішні ІД

OMIM: 600027 MGI: 101771 HomoloGene: 4911 GeneCards: SNTB2

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6645


20650

Ensembl


ENSG00000168807 ENSG00000260873


ENSMUSG00000041308

UniProt


Q13425


Q61235

RefSeq (мРНК)


NM_130845 NM_006750


NM_009229 NM_001368316

RefSeq (білок)


NP_006741 NP_006741.1


NP_033255 NP_001355245

Локус (UCSC)

Хр. 16: 69.19 – 69.31 Mb

Хр. 8: 107.66 – 107.75 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNTB2 (англ. Syntrophin beta 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 57 950^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRVAAATAAA	GAGPAMAVWT	RATKAGLVEL	LLRERWVRVV	AELSGESLSL
TGDAAAAELE	PALGPAAAAF	NGLPNGGGAG	DSLPGSPSRG	LGPPSPPAPP
RGPAGEAGAS	PPVRRVRVVK	QEAGGLGISI	KGGRENRMPI	LISKIFPGLA
ADQSRALRLG	DAILSVNGTD	LRQATHDQAV	QALKRAGKEV	LLEVKFIREV
TPYIKKPSLV	SDLPWEGAAP	QSPSFSGSED	SGSPKHQNST	KDRKIIPLKM
CFAARNLSMP	DLENRLIELH	SPDSRNTLIL	RCKDTATAHS	WFVAIHTNIM
ALLPQVLAEL	NAMLGATSTA	GGSKEVKHIA	WLAEQAKLDG	GRQQWRPVLM
AVTEKDLLLY	DCMPWTRDAW	ASPCHSYPLV	ATRLVHSGSG	CRSPSLGSDL
TFATRTGSRQ	GIEMHLFRVE	THRDLSSWTR	ILVQGCHAAA	ELIKEVSLGC
MLNGQEVRLT	IHYENGFTIS	RENGGSSSIL	YRYPFERLKM	SADDGIRNLY
LDFGGPEGEL	TMDLHSCPKP	IVFVLHTFLS	AKVTRMGLLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, молекулою кальмодуліну, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Garcia R.A., Vasudevan K., Buonanno A. (2000). The neuregulin receptor ErbB-4 interacts with PDZ-containing proteins at neuronal synapses. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 3596—3601. PMID 10725395 DOI:10.1073/pnas.97.7.3596
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11169 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13425 (англ.) . Архів оригіналу за 16 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.