SNAP25

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1KIL, 1XTG, 3DDA, 3RK2, 3RK3, 3RL0, 3ZUR, 2N1T, 3DDB

Ідентифікатори

Символи

SNAP25, CMS18, RIC-4, RIC4, SEC9, SNAP, SNAP-25, bA416N4.2, dJ1068F16.2, SUP, synaptosome associated protein 25kDa, synaptosome associated protein 25

Зовнішні ІД

OMIM: 600322 MGI: 98331 HomoloGene: 13311 GeneCards: SNAP25

Пов'язані генетичні захворювання

congenital myasthenic syndrome 18^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• SNAP receptor activity • calcium-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • SNARE binding • syntaxin-1 binding • voltage-gated potassium channel activity • syntaxin binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • везикула • гіалоплазма • мембрана • growth cone • myelin sheath • BLOC-1 complex • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • синапс • synaptobrevin 2-SNAP-25-syntaxin-1a-complexin I complex • міжклітинні контакти • trans-Golgi network • SNARE complex • perinuclear region of cytoplasm • neuron projection • Синаптичні бульбашки • presynaptic membrane • аксон • specific granule membrane • somatodendritic compartment • tertiary granule membrane • postsynapse • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • цитоскелет • glutamatergic synapse
Біологічний процес	• associative learning • regulation of neuron projection development • synaptic vesicle docking • locomotory behavior • regulation of insulin secretion • synaptic vesicle exocytosis • synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane • glutamate secretion • neurotransmitter uptake • synaptic vesicle priming • regulation of establishment of protein localization • GO:0010554 neurotransmitter secretion • довготривала потенціація • chemical synaptic transmission • positive regulation of synaptic plasticity • neutrophil degranulation • short-term synaptic potentiation • exocytic insertion of neurotransmitter receptor to postsynaptic membrane • neurotransmitter receptor internalization • екзоцитоз • vesicle fusion • potassium ion transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6616


20614

Ensembl


ENSG00000132639


ENSMUSG00000027273

UniProt


P60880


P60879

RefSeq (мРНК)

NM_003081 NM_130811 NM_001322902 NM_001322903 NM_001322904
NM_001322905 NM_001322906 NM_001322907 NM_001322908 NM_001322909 NM_001322910


NM_011428 NM_001291056 NM_001355254 NM_001355255

RefSeq (білок)

NP_001309831 NP_001309832 NP_001309833 NP_001309834 NP_001309835
NP_001309836 NP_001309837 NP_001309838 NP_001309839 NP_003072 NP_570824


NP_001277985 NP_035558 NP_001342183 NP_001342184

Локус (UCSC)

Хр. 20: 10.17 – 10.31 Mb

Хр. 2: 136.56 – 136.62 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SNAP25 (англ. Synaptosome associated protein 25) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 206 амінокислот, а молекулярна маса — 23 315^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEDADMRNE	LEEMQRRADQ	LADESLESTR	RMLQLVEESK	DAGIRTLVML
DEQGEQLERI	EEGMDQINKD	MKEAEKNLTD	LGKFCGLCVC	PCNKLKSSDA
YKKAWGNNQD	GVVASQPARV	VDEREQMAIS	GGFIRRVTND	ARENEMDENL
EQVSGIIGNL	RHMALDMGNE	IDTQNRQIDR	IMEKADSNKT	RIDEANQRAT
KMLGSG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, синапсах, синаптосомах^[en].

Література

Bark I.C., Wilson M.C. (1994). Human cDNA clones encoding two different isoforms of the nerve terminal protein SNAP-25. Gene. 139: 291—292. PMID 8112622 DOI:10.1016/0378-1119(94)90773-0
Zhao N., Hashida H., Takahashi N., Sakaki Y. (1994). Cloning and sequence analysis of the human SNAP25 cDNA. Gene. 145: 313—314. PMID 8056350 DOI:10.1016/0378-1119(94)90027-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Huang Q., Hong X., Hao Q. (2008). SNAP-25 is also an iron-sulfur protein. FEBS Lett. 582: 1431—1436. PMID 18375205 DOI:10.1016/j.febslet.2008.03.028
Shen X.M., Selcen D., Brengman J., Engel A.G. (2014). Mutant SNAP25B causes myasthenia, cortical hyperexcitability, ataxia, and intellectual disability. Neurology. 83: 2247—2255. PMID 25381298 DOI:10.1212/WNL.0000000000001079

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SNAP25 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11132 (англ.) . Архів оригіналу за 30 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P60880 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.