RRP8

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2ZFU

Ідентифікатори

Символи

RRP8, KIAA0409, NML, ribosomal RNA processing 8, methyltransferase, homolog (yeast), ribosomal RNA processing 8

Зовнішні ІД

OMIM: 615818 MGI: 1914251 HomoloGene: 5621 GeneCards: RRP8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity • methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • нуклеоплазма • rDNA heterochromatin • chromatin silencing complex • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• cellular response to glucose starvation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of transcription by glucose • transcription, DNA-templated • Метилювання • rDNA heterochromatin assembly • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • rRNA processing • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23378


101867

Ensembl


ENSG00000132275


ENSMUSG00000030888

UniProt


O43159


Q9DB85

RefSeq (мРНК)


NM_015324


NM_025897 NM_133951

RefSeq (білок)


NP_056139


NP_080173 NP_598712

Локус (UCSC)

Хр. 11: 6.6 – 6.6 Mb

Хр. 7: 105.38 – 105.39 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RRP8 (англ. Ribosomal RNA processing 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 456 амінокислот, а молекулярна маса — 50 715^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFEEPEWAEA	APVAAGLGPV	ISRPPPAASS	QNKGSKRRQL	LATLRALEAA
SLSQHPPSLC	ISDSEEEEEE	RKKKCPKKAS	FASASAEVGK	KGKKKCQKQG
PPCSDSEEEV	ERKKKCHKQA	LVGSDSAEDE	KRKRKCQKHA	PINSAQHLDN
VDQTGPKAWK	GSTTNDPPKQ	SPGSTSPKPP	HTLSRKQWRN	RQKNKRRCKN
KFQPPQVPDQ	APAEAPTEKT	EVSPVPRTDS	HEARAGALRA	RMAQRLDGAR
FRYLNEQLYS	GPSSAAQRLF	QEDPEAFLLY	HRGFQSQVKK	WPLQPVDRIA
RDLRQRPASL	VVADFGCGDC	RLASSIRNPV	HCFDLASLDP	RVTVCDMAQV
PLEDESVDVA	VFCLSLMGTN	IRDFLEEANR	VLKPGGLLKV	AEVSSRFEDV
RTFLRAVTKL	GFKIVSKDLT	NSHFFLFDFQ	KTGPPLVGPK	AQLSGLQLQP
CLYKRR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, процесінг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29030 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O43159 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.