PDZK1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2EEI, 2EEJ, 2VSP, 3TMH, 4Q2P

Ідентифікатори

Символи

PDZK1, CAP70, CLAMP, NHERF-3, NHERF3, PDZD1, PDZ domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 603831 MGI: 1928901 HomoloGene: 1964 GeneCards: PDZK1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• scavenger receptor binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • PDZ domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transporter activity
Клітинна компонента	• membrane raft • brush border membrane • клітинна мембрана • екзосома • apical plasma membrane • мембрана • microvillus membrane
Біологічний процес	• проліферація • carnitine transport • positive regulation of ion transmembrane transport • regulation of anion transport • positive regulation of protein targeting to membrane • GO:0015915 транспорт • positive regulation of ion transmembrane transporter activity • positive regulation of cation transmembrane transport • xenobiotic detoxification by transmembrane export across the plasma membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5174


59020

Ensembl


ENSG00000174827


ENSMUSG00000038298

UniProt


Q5T2W1


Q9JIL4

RefSeq (мРНК)


NM_001201325 NM_001201326 NM_002614


NM_001146001 NM_021517 NM_001355710

RefSeq (білок)


NP_001188254 NP_001188255 NP_002605 NP_001358288 NP_001358290


NP_001139473 NP_067492 NP_001342639

Локус (UCSC)

Хр. 1: 145.67 – 145.71 Mb

Хр. 3: 96.74 – 96.78 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PDZK1 (англ. PDZ domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 519 амінокислот, а молекулярна маса — 57 129^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTSTFNPREC	KLSKQEGQNY	GFFLRIEKDT	EGHLVRVVEK	CSPAEKAGLQ
DGDRVLRING	VFVDKEEHMQ	VVDLVRKSGN	SVTLLVLDGD	SYEKAVKTRV
DLKELGQSQK	EQGLSDNILS	PVMNGGVQTW	TQPRLCYLVK	EGGSYGFSLK
TVQGKKGVYM	TDITPQGVAM	RAGVLADDHL	IEVNGENVED	ASHEEVVEKV
KKSGSRVMFL	LVDKETDKRH	VEQKIQFKRE	TASLKLLPHQ	PRIVEMKKGS
NGYGFYLRAG	SEQKGQIIKD	IDSGSPAEEA	GLKNNDLVVA	VNGESVETLD
HDSVVEMIRK	GGDQTSLLVV	DKETDNMYRL	AHFSPFLYYQ	SQELPNGSVK
EAPAPTPTSL	EVSSPPDTTE	EVDHKPKLCR	LAKGENGYGF	HLNAIRGLPG
SFIKEVQKGG	PADLAGLEDE	DVIIEVNGVN	VLDEPYEKVV	DRIQSSGKNV
TLLVCGKKAY	DYFQAKKIPI	VSSLADPLDT	PPDSKEGIVV	ESNHDSHMAK
ERAHSTASHS	SSNSEDTEM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang S., Yue H., Derin R.B., Guggino W.B., Li M. (2000). Accessory protein facilitated CFTR-CFTR interaction, a molecular mechanism to potentiate the chloride channel activity. Cell. 103: 169—179. PMID 11051556 DOI:10.1016/S0092-8674(00)00096-9
Kocher O., Comella N., Tognazzi K., Brown L.F. (1998). Identification and partial characterization of PDZK1: a novel protein containing PDZ interaction domains. Lab. Invest. 78: 117—125. PMID 9461128

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8821 (англ.) . Архів оригіналу за 12 липня 2015. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q5T2W1 (англ.) . Архів оригіналу за 23 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.