PDGFC

Ідентифікатори

Символи

PDGFC, FALLOTEIN, SCDGF, platelet derived growth factor C

Зовнішні ІД

OMIM: 608452 MGI: 1859631 HomoloGene: 9423 GeneCards: PDGFC

Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • growth factor activity • platelet-derived growth factor receptor binding
Клітинна компонента	• Golgi membrane • клітинне ядро • extracellular region • endoplasmic reticulum lumen • мембрана • cell surface • екзосома • клітинна мембрана • міжклітинний простір • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to amino acid stimulus • positive regulation of cell population proliferation • bone development • positive regulation of protein autophosphorylation • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • multicellular organism development • activation of transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • central nervous system development • embryo development • positive regulation of cell division • positive regulation of cell migration • positive regulation of DNA replication • positive regulation of MAP kinase activity • animal organ morphogenesis • digestive tract development • regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • positive regulation of fibroblast proliferation • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway • зсідання крові • regulation of signaling receptor activity • embryonic organ development • positive regulation of cold-induced thermogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


56034


54635

Ensembl


ENSG00000145431


ENSMUSG00000028019

UniProt


Q9NRA1


Q8CI19

RefSeq (мРНК)


NM_016205


NM_019971 NM_001357746

RefSeq (білок)


NP_057289


NP_064355 NP_001344675

Локус (UCSC)

Хр. 4: 156.76 – 156.97 Mb

Хр. 3: 80.94 – 81.12 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PDGFC (англ. Platelet derived growth factor C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 345 амінокислот, а молекулярна маса — 39 029^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLFGLLLLT	SALAGQRQGT	QAESNLSSKF	QFSSNKEQNG	VQDPQHERII
TVSTNGSIHS	PRFPHTYPRN	TVLVWRLVAV	EENVWIQLTF	DERFGLEDPE
DDICKYDFVE	VEEPSDGTIL	GRWCGSGTVP	GKQISKGNQI	RIRFVSDEYF
PSEPGFCIHY	NIVMPQFTEA	VSPSVLPPSA	LPLDLLNNAI	TAFSTLEDLI
RYLEPERWQL	DLEDLYRPTW	QLLGKAFVFG	RKSRVVDLNL	LTEEVRLYSC
TPRNFSVSIR	EELKRTDTIF	WPGCLLVKRC	GGNCACCLHN	CNECQCVPSK
VTKKYHEVLQ	LRPKTGVRGL	HKSLTDVALE	HHEECDCVCR	GSTGG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів росту, мітогенів, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Tsai Y.J., Lee R.K., Lin S.P., Chen Y.H. (2000). Identification of a novel platelet-derived growth factor-like gene, fallotein, in the human reproductive tract. Biochim. Biophys. Acta. 1492: 196—202. PMID 11004490 DOI:10.1016/S0167-4781(00)00066-X
Hamada T., Ui-Tei K., Miyata Y. (2000). A novel gene derived from developing spinal cords, SCDGF, is a unique member of the PDGF/VEGF family. FEBS Lett. 475: 97—102. PMID 10858496 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01640-9
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zwerner J.P., May W.A. (2001). PDGF-C is an EWS/FLI induced transforming growth factor in Ewing family tumors. Oncogene. 20: 626—633. PMID 11313995 DOI:10.1038/sj.onc.1204133
Andrae J., Molander C., Smits A., Funa K., Nister M. (2002). Platelet-derived growth factor-B and -C and active alpha-receptors in medulloblastoma cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 604—611. PMID 12176024 DOI:10.1016/S0006-291X(02)00917-8
Zwerner J.P., May W.A. (2002). Dominant negative PDGF-C inhibits growth of Ewing family tumor cell lines. Oncogene. 21: 3847—3854. PMID 12032822 DOI:10.1038/sj.onc.1205486

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8801 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9NRA1 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.