NLRC5

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2MJM

Ідентифікатори

Символи

NLRC5, CLR16.1, NOD27, NOD4, NLR family, CARD domain containing 5, NLR family CARD domain containing 5

Зовнішні ІД

OMIM: 613537 MGI: 3612191 HomoloGene: 88935 GeneCards: NLRC5

Пов'язані генетичні захворювання

шизофренія, біполярний афективний розлад^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • центросома • клітинне ядро • гіалоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • negative regulation of type I interferon production • positive regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of MHC class I biosynthetic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of kinase activity • процес імунної системи • вроджений імунітет • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • response to bacterium • GO:0007243 intracellular signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


84166


434341

Ensembl


ENSG00000140853


ENSMUSG00000074151

UniProt


Q86WI3


C3VPR6

RefSeq (мРНК)


NM_032206 NM_001330552


NM_001033207

RefSeq (білок)


NP_001317481 NP_115582


NP_001028379

Локус (UCSC)

Хр. 16: 56.99 – 57.08 Mb

Хр. 8: 95.16 – 95.25 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NLRC5 (англ. NLR family CARD domain containing 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 866 амінокислот, а молекулярна маса — 204 595^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDPVGLQLGN	KNLWSCLVRL	LTKDPEWLNA	KMKFFLPNTD	LDSRNETLDP
EQRVILQLNK	LHVQGSDTWQ	SFIHCVCMQL	EVPLDLEVLL	LSTFGYDDGF
TSQLGAEGKS	QPESQLHHGL	KRPHQSCGSS	PRRKQCKKQQ	LELAKKYLQL
LRTSAQQRYR	SQIPGSGQPH	AFHQVYVPPI	LRRATASLDT	PEGAIMGDVK
VEDGADVSIS	DLFNTRVNKG	PRVTVLLGKA	GMGKTTLAHR	LCQKWAEGHL
NCFQALFLFE	FRQLNLITRF	LTPSELLFDL	YLSPESDHDT	VFQYLEKNAD
QVLLIFDGLD	EALQPMGPDG	PGPVLTLFSH	LCNGTLLPGC	RVMATSRPGK
LPACLPAEAA	MVHMLGFDGP	RVEEYVNHFF	SAQPSREGAL	VELQTNGRLR
SLCAVPALCQ	VACLCLHHLL	PDHAPGQSVA	LLPNMTQLYM	QMVLALSPPG
HLPTSSLLDL	GEVALRGLET	GKVIFYAKDI	APPLIAFGAT	HSLLTSFCVC
TGPGHQQTGY	AFTHLSLQEF	LAALHLMASP	KVNKDTLTQY	VTLHSRWVQR
TKARLGLSDH	LPTFLAGLAS	CTCRPFLSHL	AQGNEDCVGA	KQAAVVQVLK
KLATRKLTGP	KVVELCHCVD	ETQEPELASL	TAQSLPYQLP	FHNFPLTCTD
LATLTNILEH	REAPIHLDFD	GCPLEPHCPE	ALVGCGQIEN	LSFKSRKCGD
AFAEALSRSL	PTMGRLQMLG	LAGSKITARG	ISHLVKALPL	CPQLKEVSFR
DNQLSDQVVL	NIVEVLPHLP	RLRKLDLSSN	SICVSTLLCL	ARVAVTCPTV
RMLQAREADL	IFLLSPPTET	TAELQRAPDL	QESDGQRKGA	QSRSLTLRLQ
KCQLQVHDAE	ALIALLQEGP	HLEEVDLSGN	QLEDEGCRLM	AEAASQLHIA
RKLDLSNNGL	SVAGVHCVLR	AVSACWTLAE	LHISLQHKTV	IFMFAQEPEE
QKGPQERAAF	LDSLMLQMPS	ELPLSSRRMR	LTHCGLQEKH	LEQLCKALGG
SCHLGHLHLD	FSGNALGDEG	AARLAQLLPG	LGALQSLNLS	ENGLSLDAVL
GLVRCFSTLQ	WLFRLDISFE	SQHILLRGDK	TSRDMWATGS	LPDFPAAAKF
LGFRQRCIPR	SLCLSECPLE	PPSLTRLCAT	LKDCPGPLEL	QLSCEFLSDQ
SLETLLDCLP	QLPQLSLLQL	SQTGLSPKSP	FLLANTLSLC	PRVKKVDLRS
LHHATLHFRS	NEEEEGVCCG	RFTGCSLSQE	HVESLCWLLS	KCKDLSQVDL
SANLLGDSGL	RCLLECLPQV	PISGLLDLSH	NSISQESALY	LLETLPSCPR
VREASVNLGS	EQSFRIHFSR	EDQAGKTLRL	SECSFRPEHV	SRLATGLSKS
LQLTELTLTQ	CCLGQKQLAI	LLSLVGRPAG	LFSLRVQEPW	ADRARVLSLL
EVCAQASGSV	TEISISETQQ	QLCVQLEFPR	QEENPEAVAL	RLAHCDLGAH
HSLLVGQLME	TCARLQQLSL	SQVNLCEDDD	ASSLLLQSLL	LSLSELKTFR
LTSSCVSTEG	LAHLASGLGH	CHHLEELDLS	NNQFDEEGTK	ALMRALEGKW
MLKRLDLSHL	LLNSSTLALL	THRLSQMTCL	QSLRLNRNSI	GDVGCCHLSE
ALRAATSLEE	LDLSHNQIGD	AGVQHLATIL	PGLPELRKID	LSGNSISSAG
GVQLAESLVL	CRRLEELMLG	CNALGDPTAL	GLAQELPQHL	RVLHLPFSHL
GPGGALSLAQ	ALDGSPHLEE	ISLAENNLAG	GVLRFCMELP	LLRQIDLVSC
KIDNQTAKLL	TSSFTSCPAL	EVILLSWNLL	GDEAAAELAQ	VLPQMGRLKR
VDLEKNQITA	LGAWLLAEGL	AQGSSIQVIR	LWNNPIPCDM	AQHLKSQEPR
LDFAFFDNQP	QAPWGT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Ting J.P.-Y., Davis B.K. (2005). CATERPILLER: a novel gene family important in immunity, cell death, and diseases. Annu. Rev. Immunol. 23: 387—414. PMID 15771576 DOI:10.1146/annurev.immunol.23.021704.115616

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NLRC5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29933 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q86WI3 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2012. Процитовано 11 вересня 2017.