MMP16

MMP16
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1RM8

Ідентифікатори
Символи MMP16, C8orf57, MMP-X2, MT-MMP2, MT-MMP3, MT3-MMP, matrix metallopeptidase 16
Зовнішні ІД OMIM: 602262 MGI: 1276107 HomoloGene: 55939 GeneCards: MMP16
Онтологія гена
Молекулярна функція

• зв'язування з іоном металу
• GO:0070122 peptidase activity
• GO:0010577 enzyme activator activity
• hydrolase activity
• metallopeptidase activity
• metalloendopeptidase activity
• zinc ion binding
• metalloaminopeptidase activity

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• мембрана
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• клітинна мембрана
• extracellular region
• cell surface
• Golgi lumen
• integral component of plasma membrane
• міжклітинний простір

Біологічний процес

• осифікація
• extracellular matrix disassembly
• осифікація ендохондральна
• craniofacial suture morphogenesis
• chondrocyte proliferation
• collagen catabolic process
• embryonic cranial skeleton morphogenesis
• bone development
• GO:0048554 positive regulation of catalytic activity
• протеоліз
• protein processing
• GO:0044267 protein metabolic process
• skeletal system development
• extracellular matrix organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4325
17389
Ensembl
ENSG00000156103
ENSMUSG00000028226
UniProt
P51512
Q9WTR0
RefSeq (мРНК)
NM_005941
NM_022564
NM_032297
NM_019724
NM_001379518
NM_001379519
RefSeq (білок)
NP_005932
NP_062698
NP_001366447
NP_001366448
Локус (UCSC) Хр. 8: 88.03 – 88.33 Mb Хр. 4: 17.85 – 18.12 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MMP16 (англ. Matrix metallopeptidase 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 69 521[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MILLTFSTGRRLDFVHHSGVFFLQTLLWILCATVCGTEQYFNVEVWLQKY
GYLPPTDPRMSVLRSAETMQSALAAMQQFYGINMTGKVDRNTIDWMKKPR
CGVPDQTRGSSKFHIRRKRYALTGQKWQHKHITYSIKNVTPKVGDPETRK
AIRRAFDVWQNVTPLTFEEVPYSELENGKRDVDITIIFASGFHGDSSPFD
GEGGFLAHAYFPGPGIGGDTHFDSDEPWTLGNPNHDGNDLFLVAVHELGH
ALGLEHSNDPTAIMAPFYQYMETDNFKLPNDDLQGIQKIYGPPDKIPPPT
RPLPTVPPHRSIPPADPRKNDRPKPPRPPTGRPSYPGAKPNICDGNFNTL
AILRREMFVFKDQWFWRVRNNRVMDGYPMQITYFWRGLPPSIDAVYENSD
GNFVFFKGNKYWVFKDTTLQPGYPHDLITLGSGIPPHGIDSAIWWEDVGK
TYFFKGDRYWRYSEEMKTMDPGYPKPITVWKGIPESPQGAFVHKENGFTY
FYKGKEYWKFNNQILKVEPGYPRSILKDFMGCDGPTDRVKEGHSPPDDVD
IVIKLDNTASTVKAIAIVIPCILALCLLVLVYTVFQFKRKGTPRHILYCK
RSMQEWV

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Takino T., Sato H., Shinagawa A., Seiki M. (1995). Identification of the second membrane-type matrix metalloproteinase (MT-MMP-2) gene from a human placenta cDNA library. MT-MMPs form a unique membrane-type subclass in the MMP family. J. Biol. Chem. 270: 23013—23020. PMID 7559440 DOI:10.1074/jbc.270.39.23013
  • Matsumoto S., Katoh M., Saito S., Watanabe T., Masuho Y. (1997). Identification of soluble type of membrane-type matrix metalloproteinase-3 formed by alternatively spliced mRNA. Biochim. Biophys. Acta. 1354: 159—170. PMID 9396633 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00120-6
  • Shofuda K., Yasumitsu H., Nishihashi A., Miki K., Miyazaki K. (1997). Expression of three membrane-type matrix metalloproteinases (MT-MMPs) in rat vascular smooth muscle cells and characterization of MT3-MMPs with and without transmembrane domain. J. Biol. Chem. 272: 9749—9754. PMID 9092507 DOI:10.1074/jbc.272.15.9749
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7162 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, P51512 (англ.) . Архів оригіналу за 1 червня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
  • п
  • о
  • р
Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM
Матриксні металопротеїнази

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.