DDC

DDC
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3RBF, 3RBL, 3RCH

Ідентифікатори
Символи DDC, AADC, dopa decarboxylase
Зовнішні ІД OMIM: 107930 MGI: 94876 HomoloGene: 618 GeneCards: DDC
Пов'язані генетичні захворювання
малярія, aromatic L-amino acid decarboxylase deficiency[1]
Реагує на сполуку
benserazide[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• amino acid binding
• protein domain specific binding
• aromatic-L-amino-acid decarboxylase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• каталітична активність
• L-dopa decarboxylase activity
• lyase activity
• enzyme binding
• pyridoxal phosphate binding
• carboxy-lyase activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• Синаптичні бульбашки
• аксон
• neuronal cell body
• екзосома

Біологічний процес

• carboxylic acid metabolic process
• dopamine biosynthetic process
• cellular response to growth factor stimulus
• isoquinoline alkaloid metabolic process
• cellular amino acid metabolic process
• catecholamine biosynthetic process
• cellular response to alkaloid
• indolalkylamine biosynthetic process
• serotonin biosynthetic process
• циркадний ритм
• multicellular organism aging
• response to pyrethroid
• phytoalexin metabolic process
• response to toxic substance
• aminergic neurotransmitter loading into synaptic vesicle

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1644
13195
Ensembl
ENSG00000132437
ENSMUSG00000020182
UniProt
P20711
O88533
RefSeq (мРНК)
NM_000790
NM_001082971
NM_001242886
NM_001242887
NM_001242888
NM_001242889
NM_001242890
NM_001190448
NM_016672
RefSeq (білок)
NP_000781
NP_001076440
NP_001229815
NP_001229816
NP_001229817
NP_001229818
NP_001229819
NP_001177377
NP_057881
Локус (UCSC) Хр. 7: 50.46 – 50.57 Mb Хр. 11: 11.76 – 11.85 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DDC (англ. Dopa decarboxylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот, а молекулярна маса — 53 926[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNASEFRRRGKEMVDYMANYMEGIEGRQVYPDVEPGYLRPLIPAAAPQEP
DTFEDIINDVEKIIMPGVTHWHSPYFFAYFPTASSYPAMLADMLCGAIGC
IGFSWAASPACTELETVMMDWLGKMLELPKAFLNEKAGEGGGVIQGSASE
ATLVALLAARTKVIHRLQAASPELTQAAIMEKLVAYSSDQAHSSVERAGL
IGGVKLKAIPSDGNFAMRASALQEALERDKAAGLIPFFMVATLGTTTCCS
FDNLLEVGPICNKEDIWLHVDAAYAGSAFICPEFRHLLNGVEFADSFNFN
PHKWLLVNFDCSAMWVKKRTDLTGAFRLDPTYLKHSHQDSGLITDYRHWQ
IPLGRRFRSLKMWFVFRMYGVKGLQAYIRKHVQLSHEFESLVRQDPRFEI
CVEVILGLVCFRLKGSNKVNEALLQRINSAKKIHLVPCHLRDKFVLRFAI
CSRTVESAHVQRAWEHIKELAADVLRAERE

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.

Література

  • Ichinose H., Kurosawa Y., Titani K., Fujita K., Nagatsu T. (1989). Isolation and characterization of a cDNA clone encoding human aromatic L-amino acid decarboxylase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 164: 1024—1030. PMID 2590185 DOI:10.1016/0006-291X(89)91772-5
  • Scherer L.J., McPherson J.D., Wasmuth J.J., Marsh L.J. (1992). Human dopa decarboxylase: localization to human chromosome 7p11 and characterization of hepatic cDNAs. Genomics. 13: 469—471. PMID 1612608 DOI:10.1016/0888-7543(92)90275-W
  • Sumi-Ichinose C., Ichinose H., Takahashi E., Hori T., Nagatsu T. (1992). Molecular cloning of genomic DNA and chromosomal assignment of the gene for human aromatic L-amino acid decarboxylase, the enzyme for catecholamine and serotonin biosynthesis. Biochemistry. 31: 2229—2238. PMID 1540578 DOI:10.1021/bi00123a004
  • Vassilacopoulou D.S., Sideris D.C., Vassiliou A.G., Fragoulis E.G. (2004). Identification and characterization of a novel form of the human L-dopa decarboxylase mRNA. Neurochem. Res. 29: 1817—1823. PMID 15532536 DOI:10.1023/B:NERE.0000042207.05071.ea
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Van Thai A., Coste E., Allen J.M., Palmiter R.D., Weber M.J. (1993). Identification of a neuron-specific promoter of human aromatic L-amino acid decarboxylase gene. Brain Res. Mol. Brain Res. 17: 227—238. PMID 8510497 DOI:10.1016/0169-328X(93)90006-B

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з DDC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з dopa decarboxylase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2719 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
  6. ↑ UniProt, P20711 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 7
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»