CTCFL

Ідентифікатори

Символи

CTCFL, BORIS, CT27, CTCF-T, HMGB1L1, dJ579F20.2, CCCTC-binding factor like

Зовнішні ІД

OMIM: 607022 MGI: 3652571 HomoloGene: 46476 GeneCards: CTCFL

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0031493 histone binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес	• regulation of gene expression by genetic imprinting • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of histone H3-K4 methylation • DNA methylation involved in gamete generation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • клітинний цикл • histone methylation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


140690


664799

Ensembl


н/д


ENSMUSG00000070495

UniProt


Q8NI51


A2APF3

RefSeq (мРНК)

NM_001269040 NM_001269041 NM_001269042 NM_001269043 NM_001269044
NM_001269045 NM_001269046 NM_001269047 NM_001269048 NM_001269049 NM_001269050 NM_001269051 NM_001269052 NM_001269054 NM_001269055 NM_080618 NM_001386993 NM_001386994 NM_001386995 NM_001386996 NM_001386997


NM_001081387 NM_001355185

RefSeq (білок)

NP_001255969 NP_001255970 NP_001255971 NP_001255972 NP_001255973
NP_001255974 NP_001255975 NP_001255976 NP_001255977 NP_001255978 NP_001255979 NP_001255980 NP_001255981 NP_001255983 NP_001255984 NP_542185


NP_001074856 NP_001342114

Локус (UCSC)

н/д

Хр. 2: 172.94 – 172.96 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CTCFL (англ. CCCTC-binding factor like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 663 амінокислот, а молекулярна маса — 75 747^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAATEISVLS	EQFTKIKELE	LMPEKGLKEE	EKDGVCREKD	HRSPSELEAE
RTSGAFQDSV	LEEEVELVLA	PSEESEKYIL	TLQTVHFTSE	AVELQDMSLL
SIQQQEGVQV	VVQQPGPGLL	WLEEGPRQSL	QQCVAISIQQ	ELYSPQEMEV
LQFHALEENV	MVASEDSKLA	VSLAETTGLI	KLEEEQEKNQ	LLAERTKEQL
FFVETMSGDE	RSDEIVLTVS	NSNVEEQEDQ	PTAGQADAEK	AKSTKNQRKT
KGAKGTFHCD	VCMFTSSRMS	SFNRHMKTHT	SEKPHLCHLC	LKTFRTVTLL
RNHVNTHTGT	RPYKCNDCNM	AFVTSGELVR	HRRYKHTHEK	PFKCSMCKYA
SVEASKLKRH	VRSHTGERPF	QCCQCSYASR	DTYKLKRHMR	THSGEKPYEC
HICHTRFTQS	GTMKIHILQK	HGENVPKYQC	PHCATIIARK	SDLRVHMRNL
HAYSAAELKC	RYCSAVFHER	YALIQHQKTH	KNEKRFKCKH	CSYACKQERH
MTAHIRTHTG	EKPFTCLSCN	KCFRQKQLLN	AHFRKYHDAN	FIPTVYKCSK
CGKGFSRWIN	LHRHSEKCGS	GEAKSAASGK	GRRTRKRKQT	ILKEATKGQK
EAAKGWKEAA	NGDEAAAEEA	STTKGEQFPG	EMFPVACRET	TARVKEEVDE
GVTCEMLLNT	MDK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Jelinic P., Stehle J.-C., Shaw P. (2006). The testis-specific factor CTCFL cooperates with the protein methyltransferase PRMT7 in H19 imprinting control region methylation. PLoS Biol. 4: E355—E355. PMID 17048991 DOI:10.1371/journal.pbio.0040355
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Klenova E.M., Morse H.C. III, Ohlsson R., Lobanenkov V.V. (2002). The novel BORIS + CTCF gene family is uniquely involved in the epigenetics of normal biology and cancer. Semin. Cancer Biol. 12: 399—414. PMID 12191639 DOI:10.1016/S1044-579X(02)00060-3

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16234 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8NI51 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.