CCL27 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CCL27

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2KUM

Ідентифікатори

Символи

CCL27, ALP, CTACK, CTAK, ESKINE, ILC, PESKY, SCYA27, C-C motif chemokine ligand 27

Зовнішні ІД

OMIM: 604833 MGI: 1891389 HomoloGene: 104838 GeneCards: CCL27

Онтологія гена
Молекулярна функція	• chemokine activity • cytokine activity • CCR3 chemokine receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір
Біологічний процес	• хемотаксис • cell-cell signaling • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cell chemotaxis • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of T cell chemotaxis • positive regulation of mononuclear cell migration • positive regulation of actin cytoskeleton reorganization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10850


100040048

Ensembl


ENSG00000213927


ENSMUSG00000096826

UniProt


Q9Y4X3


Q9Z1X0

RefSeq (мРНК)


NM_006664


NM_001199959 NM_001199960 NM_001199961

RefSeq (білок)


NP_006655

NP_001041644 NP_001157516 NP_001157517 NP_001333994 NP_001348175
NP_035466

Локус (UCSC)

Хр. 9: 34.66 – 34.66 Mb

Хр. 4: 42.66 – 42.66 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CCL27 (англ. C-C motif chemokine ligand 27) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 112 амінокислот, а молекулярна маса — 12 618^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKGPPTFCSL	LLLSLLLSPD	PTAAFLLPPS	TACCTQLYRK	PLSDKLLRKV
IQVELQEADG	DCHLQAFVLH	LAQRSICIHP	QNPSLSQWFE	HQERKLHGTL
PKLNFGMLRK	MG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Секретований назовні.

Література

Jansma A.L., Kirkpatrick J.P., Hsu A.R., Handel T.M., Nietlispach D. (2010). NMR analysis of the structure, dynamics, and unique oligomerization properties of the chemokine CCL27. J. Biol. Chem. 285: 14424—14437. PMID 20200157 DOI:10.1074/jbc.M109.091108

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10626 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y4X3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.