MEROPS

MEROPS
Kontent
OpisMEROPS: baza podataka proteolitičkih enzima, njihovih supstrata i inhibitora.
Kontakt
Istraživački centarVelkam trust Sanger institut
AutoriNil D Rolings
Primarna citacijaRawlings & al. (2012)[1]
Datum objavljivanja2010
Pristup
Veb stranicamerops.sanger.ac.uk
Alati
Razno

MEROPS je onlajn baza podataka za peptidaze (proteaze) i njihove inhibitore.[2] Klasifikacioni pregled peptidaza je objavljen 1993,[3] a pregled inhibitora proteina 2004.[4]

Povezano

  • Mapa proteolize
  • TopFIND

Reference

  1. Rawlings, Neil D; Barrett Alan J, Bateman Alex (Jan 2012). „MEROPS: the database of proteolytic enzymes, their substrates and inhibitors” (eng). Nucleic Acids Res. (England) 40 (Database issue): D343-50. DOI:10.1093/nar/gkr987. PMC 3245014. PMID 22086950. 
  2. Rawlings ND, Barrett AJ, Bateman A (January 2010). „MEROPS: the peptidase database”. Nucleic Acids Res. 38 (Database issue): D227–33. DOI:10.1093/nar/gkp971. PMC 2808883. PMID 19892822. 
  3. Rawlings, N.D. & Barrett, A.J. (1993) Evolutionary families of peptidases. Biochem J 290, 205-218.
  4. Rawlings, N.D., Tolle, D.P. & Barrett, A.J. (2004) Evolutionary families of peptidase inhibitors. Biochem J 378, 705-716.

Spoljašnje veze

  • MEROPS database Arhivirano 2006-11-14 na Wayback Machine-u
  • p
  • r
  • u
Hidrolaze: Proteaze (EC 3.4)
3.4.11-19: Eksopeptidaza
3.4.11
Aminopeptidaza (Alanin, Arginil, Aspartil, Cistinil, Leucil, Glutamil, Metionil (1, 2), O)
3.4.13
Dipeptidaza (1, 2, 3)
3.4.14
Dipeptidil peptidaza (Katepsin C, Dipeptidil peptidaza-4)  Tripeptidil peptidaza (Tripeptidil peptidaza I, Tripeptidil peptidaza II)
3.4.15
3.4.16
Karboksipeptidaze serinskog tipa: Katepsin A  DD-transpeptidaza
3.4.17
Metalokarboksipeptidaze: Karboksipeptidaza (A, A2, B, C, E, Glutamat II)
Drugi/negrupisni
Metaloeksopeptidaza
3.4.21-24: Endopeptidaza
Serinske peptidaze  Cisteinska proteaza  Aspartatna proteaza  Metaloendopeptidaze
Druge/negrupisane: Sekretaza amiloidnog prekursornog proteina (Alfa-sekretaza, Beta-sekretaza 1, Beta-sekretaza 2, Gama sekretaza)
3.4.99: Nepoznato
Stafilokinaza
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • p
  • r
  • u
Teme
Tipovi
EC1 Oksidoreduktaze/spisak  • EC2 Transferaze/spisak  • EC3 Hidrolaze/spisak  • EC4 Lijaze/spisak  • EC5 Izomeraze/spisak  • EC6 Ligaze/spisak
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6