TNP1

TNP1
Идентификаторы
ПсевдонимыTNP1, TP1, transition protein 1
Внешние IDOMIM: 190231 MGI: 98784 HomoloGene: 136517 GeneCards: TNP1
Расположение гена (человек)
2-я хромосома человека
Хр.2-я хромосома человека[1]
2-я хромосома человека
Расположение в геноме TNP1
Расположение в геноме TNP1
Локус2q35Начало216,859,458 bp[1]
Конец216,860,064 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме TNP1
Расположение в геноме TNP1
Локус1 C3|1 36.94 cMНачало73,054,233 bp[2]
Конец73,055,068 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • right testis

  • left testis

  • tail of epididymis

  • caput epididymis

  • paraflocculus of cerebellum

  • corpus epididymis
Наибольшая экспрессия в
  • seminiferous tubule

  • interventricular septum

  • cardiac muscle tissue of left ventricle

  • choroid plexus of fourth ventricle
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • ДНК-связывающий
  • связывание с белками плазмы
Компонент клетки
  • male germ cell nucleus
  • нуклеосома
  • хромосома
  • клеточное ядро
Биологический процесс
  • multicellular organism development
  • single strand break repair
  • flagellated sperm motility
  • ремоделирование хроматина
  • spermatid nucleus differentiation
  • дифференцировка клеток
  • spermatid nucleus elongation
  • nucleosome disassembly
  • negative regulation of transcription, DNA-templated
  • половое размножение
  • Сперматогенез
  • spermatid development
  • positive regulation of protein processing
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

7141

21958

Ensembl

ENSG00000118245

ENSMUSG00000026182

UniProt

P09430

P10856

RefSeq (мРНК)

NM_003284

NM_009407

RefSeq (белок)

NP_003275

NP_033433

Локус (UCSC)Chr 2: 216.86 – 216.86 MbChr 1: 73.05 – 73.06 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Переходный ядерный белок сперматид номер один (англ. Spermatid nuclear transition protein 1) — белок, который у человека кодируется геном TNP1[5][6]. Данный белок имеет центральное значение в сперматогенезе. Мутации в этом гене могут вызывать нарушения образования сперматозоидов, тем самым приводя к бесплодию[7]. Белок TNP1 состоит из 54 остатков аминокислот с общей молекулярной массой 6,2 кДа. Аминокислоты аргинин и лизин распределены равномерно и составляют около 40% белка. Цистеин отсутствует. Исследования in vitro показали, что белок TNP1 снижает температуру плавления ДНК, высвобождая ее из нуклеосом[8]. В удлиняющихся сперматозоидах млекопитающих участвует в замене гистонов на протамин[9].

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000118245 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026182 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Luerssen H., Mattei M. G., Schroter M., Grzeschik K. H., Adham I. M., Engel W. Nucleotide sequence of the gene for human transition protein 1 and its chromosomal localization on chromosome 2 (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1991. — January (vol. 8, no. 2). — P. 324—330. — doi:10.1016/0888-7543(90)90289-7. — PMID 2249851.
  6. Entrez Gene: TNP1 transition protein 1 (during histone to protamine replacement)  (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.
  7. Shuai Zhang, Yan Zhang, Chunhong Yang, Wei Zhang, Zhihua Ju. TNP1 Functional SNPs in bta-miR-532 and bta-miR-204 Target Sites Are Associated with Semen Quality Traits in Chinese Holstein Bulls1 (англ.) // Biology of Reproduction. — 2015-06-01. — Vol. 92, iss. 6. — ISSN 1529-7268 0006-3363, 1529-7268. — doi:10.1095/biolreprod.114.126672.
  8. Torres-Flores U., Hernández-Hernández A. The Interplay Between Replacement and Retention of Histones in the Sperm Genome (англ.) // Frontiers in Genetics. — 2020. — Vol. 11. — P. 780. — ISSN 1664-8021. — doi:10.3389/fgene.2020.00780.
  9. UniProtKB - P09430 (STP1_HUMAN) (англ.). uniprot. Дата обращения: 3 января 2021. Архивировано 7 мая 2021 года.
Перейти к шаблону «Клеточное ядро»
Ядерная мембрана/
Ядерная ламина
  • Ядерные поры: Нуклеопорины
    • NUP35[англ.]
    • NUP37[англ.]
    • NUP43[англ.]
    • NUP50[англ.]
    • NUP54[англ.]
    • NUP62[англ.]
    • NUP85[англ.]
    • NUP88[англ.]
    • NUP93[англ.]
    • NUP98[англ.]
    • NUP107[англ.]
    • NUP133[англ.]
    • NUP153[англ.]
    • NUP155[англ.]
    • NUP160
    • NUP188[англ.]
    • NUP205[англ.]
    • NUP210[англ.]
    • NUP214[англ.]
  • AAAS
П:
ЯдрышкоИзбранная статья
Прочее
PML-тельцаХорошая статья
SMC-белки
Переходные
ядерные белки