SF3B3

معرفات

أسماء بديلة

SF3B3, RSE1, SAP130, SF3b130, STAF130, splicing factor 3b subunit 3

معرفات خارجية

الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 605592 MGI: MGI:1289341 HomoloGene: 6579 GeneCards: 23450

علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني • RNA binding • ربط حمض نووي • ‏GO:0032403 protein-containing complex binding
مكونات خلوية	• catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • U12-type spliceosomal complex • نوية • small nuclear ribonucleoprotein complex • نواة • بلازم نووي • U2-type precatalytic spliceosome
عمليات حيوية	• RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • تضفير الآر أن إيه • ‏GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • ‏GO:0034622 protein-containing complex assembly
المصادر:Amigo / QuickGO

نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي

المزيد من بيانات التعبير المرجعية

تماثلات متسلسلة

أنواع

الإنسان

الفأر

أنتريه

23450

101943

Ensembl

ENSG00000189091

ENSMUSG00000033732

يونيبروت


Q15393 J3QKV4


Q921M3

RefSeq (رنا مرسال.)


NM_012426


‏XM_006530518، ‏XM_030243208 NM_133953، ‏XM_006530518، ‏XM_030243208

RefSeq (بروتين)


NP_036558


‏XP_006530581، ‏XP_030099068 NP_598714، ‏XP_006530581، ‏XP_030099068

الموقع (UCSC

n/a

Chr 8: 111.54 – 111.57 Mb

بحث ببمد

[1]

[2]

ويكي بيانات

اعرض/عدّل إنسان

اعرض/عدّل فأر

SF3B3‏ (Splicing factor 3b subunit 3) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SF3B3 في الإنسان.^[1]^[1]^[2]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

^ ^ا ^ب "Entrez Gene: SF3B3 splicing factor 3b, subunit 3, 130kDa". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
^ Das BK؛ Xia L؛ Palandjian L؛ Gozani O؛ Chyung Y؛ Reed R (فبراير 2000). "Characterization of a Protein Complex Containing Spliceosomal Proteins SAPs 49, 130, 145, and 155". Mol Cell Biol. ج. 19 ع. 10: 6796–802. DOI:10.1128/mcb.19.10.6796. PMC:84676. PMID:10490618.

قراءة متعمقة

Nomura N، Miyajima N، Sazuka T، وآخرون (1995). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. I. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0001-KIAA0040) deduced by analysis of randomly sampled cDNA clones from human immature myeloid cell line KG-1". DNA Res. ج. 1 ع. 1: 27–35. DOI:10.1093/dnares/1.1.27. PMID:7584026.
Nomura N، Miyajima N، Sazuka T، وآخرون (1995). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. I. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0001-KIAA0040) deduced by analysis of randomly sampled cDNA clones from human immature myeloid cell line KG-1 (supplement)". DNA Res. ج. 1 ع. 1: 47–56. DOI:10.1093/dnares/1.1.47. PMID:7584028.
Bonaldo MF؛ Lennon G؛ Soares MB (1997). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. ج. 6 ع. 9: 791–806. DOI:10.1101/gr.6.9.791. PMID:8889548.
Mintz PJ، Patterson SD، Neuwald AF، وآخرون (1999). "Purification and biochemical characterization of interchromatin granule clusters". EMBO J. ج. 18 ع. 15: 4308–20. DOI:10.1093/emboj/18.15.4308. PMC:1171507. PMID:10428969.
Brand M، Moggs JG، Oulad-Abdelghani M، وآخرون (2001). "UV-damaged DNA-binding protein in the TFTC complex links DNA damage recognition to nucleosome acetylation". EMBO J. ج. 20 ع. 12: 3187–96. DOI:10.1093/emboj/20.12.3187. PMC:150203. PMID:11406595.
Gangloff YG، Pointud JC، Thuault S، وآخرون (2001). "The TFIID Components Human TAFII140 and Drosophila BIP2 (TAFII155) Are Novel Metazoan Homologues of Yeast TAFII47 Containing a Histone Fold and a PHD Finger". Mol. Cell. Biol. ج. 21 ع. 15: 5109–21. DOI:10.1128/MCB.21.15.5109-5121.2001. PMC:87236. PMID:11438666.
Will CL، Schneider C، MacMillan AM، وآخرون (2001). "A novel U2 and U11/U12 snRNP protein that associates with the pre-mRNA branch site". EMBO J. ج. 20 ع. 16: 4536–46. DOI:10.1093/emboj/20.16.4536. PMC:125580. PMID:11500380.
Martinez E، Palhan VB، Tjernberg A، وآخرون (2001). "Human STAGA Complex Is a Chromatin-Acetylating Transcription Coactivator That Interacts with Pre-mRNA Splicing and DNA Damage-Binding Factors In Vivo". Mol. Cell. Biol. ج. 21 ع. 20: 6782–95. DOI:10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001. PMC:99856. PMID:11564863.
Jurica MS، Licklider LJ، Gygi SR، وآخرون (2002). "Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis". RNA. ج. 8 ع. 4: 426–39. DOI:10.1017/S1355838202021088. PMC:1370266. PMID:11991638.
Scott MP، Zappacosta F، Kim EY، وآخرون (2002). "Identification of novel SH3 domain ligands for the Src family kinase Hck. Wiskott-Aldrich syndrome protein (WASP), WASP-interacting protein (WIP), and ELMO1". J. Biol. Chem. ج. 277 ع. 31: 28238–46. DOI:10.1074/jbc.M202783200. PMID:12029088.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Will CL، Urlaub H، Achsel T، وآخرون (2002). "Characterization of novel SF3b and 17S U2 snRNP proteins, including a human Prp5p homologue and an SF3b DEAD-box protein". EMBO J. ج. 21 ع. 18: 4978–88. DOI:10.1093/emboj/cdf480. PMC:126279. PMID:12234937.
Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
Cavusoglu N؛ Brand M؛ Tora L؛ Van Dorsselaer A (2003). "Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis". Proteomics. ج. 3 ع. 2: 217–23. DOI:10.1002/pmic.200390030. PMID:12601814.
Li J، Hawkins IC، Harvey CD، وآخرون (2003). "Regulation of Alternative Splicing by SRrp86 and Its Interacting Proteins". Mol. Cell. Biol. ج. 23 ع. 21: 7437–47. DOI:10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC:207616. PMID:14559993.
Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T، وآخرون (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.
Will CL، Schneider C، Hossbach M، وآخرون (2004). "The human 18S U11/U12 snRNP contains a set of novel proteins not found in the U2-dependent spliceosome". RNA. ج. 10 ع. 6: 929–41. DOI:10.1261/rna.7320604. PMC:1370585. PMID:15146077.
Jin J، Smith FD، Stark C، وآخرون (2004). "Proteomic, functional, and domain-based analysis of in vivo 14-3-3 binding proteins involved in cytoskeletal regulation and cellular organization". Curr. Biol. ج. 14 ع. 16: 1436–50. DOI:10.1016/j.cub.2004.07.051. PMID:15324660.
Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA، وآخرون (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
Ewing RM، Chu P، Elisma F، وآخرون (2007). "Large-scale mapping of human protein–protein interactions by mass spectrometry". Mol. Syst. Biol. ج. 3 ع. 1: 89. DOI:10.1038/msb4100134. PMC:1847948. PMID:17353931.